Modelagem molecular

O que é?

"Segundo a IUPAC, é a investigação das estruturas e das propriedades moleculares pelo uso de Química computacional e técnicas de visualização gráfica, visando fornecer uma representação tridimensional, sob um dado conjunto de circunstâncias".

Sant’Anna. C.M.R.; Quim. Nova 2002, 25, 505.

Química medicinal e os métodos de modelagem molecular

Métodos computacionais são ferramentas amplamente empregadas nos projetos de P&D de novos fármacos, desde a identificação de moléculas com atividade biológica até a otimização múltiplas de propriedades de compostos líderes. Devido à rápida evolução nas áreas de hardware, software e métodos, os processos computacionais anteriormente executados exclusivamente em estações de trabalho de alto desempenho são hoje em dia realizados em microcomputadores numa escala de tempo bastante razoável. Diante desse cenário, a integração entre técnicas experimentais e computacionais assumiu grande importância no processo de planejamento de fármacos.

Objetivo do uso da modelagem molecular

O estudo da geometria e das propriedades dos fármacos podem explorar as bases químicas e moleculares envolvidas na interação fármaco-receptor, pelo emprego de técnicas computacionais.

De forma mais específica, os objetivos podem ser descritos como: 

- Proporcionar a visualização tridimensional e realizar a análise conformacional de fármacos;

- Analisar o tamanho e formato do grupo farmacofórico; 

- Verificar a importância da natureza e grau de substituição de grupos funcionais; 

- Observar os aspectos estereoquímicos dos fármacos e sua relação com a atividade biológica;

- Relacionar a estrutura e as propriedades físicas de uma mesma série de fármacos;

- Predizer os mecanismos moleculares envolvidos na ação dos fármacos 

Referências

http://www.scielo.br/pdf/qn/v26n3/15672.pdf
http://www.farmacia.ufrj.br/lassbio/XIV_evqf/download/curso_nelilma.pdf
http://www.rpqsenai.org.br/index.php?option=com_k2&view=item&task=download&id=30_4c37ffa4cccee9625101636bbbb6989c